ルナの怒りをマイナスエネルギーに変換できると確信したキャンサーは、怒りをさらに増幅させるため、ミソラが出演しているテレビドラマを参考にしてある作戦を企てる。一方ハープ･ノートは、目の前に頻繁に現れるキャンサー・バブルにうんざりしていた。

世の中のためになるものを発明したいと考えた宇田海は色々な発明品を製作するが失敗ばかり。天地は宇田海に電波ウィルスを退治できるような装置を作れないかとアドバイスする。張り切って開発を進める宇田海だが･･･

宇田海の発明品・電波ウィルス誘引装置が誤作動し、アマケン内に電波ウィルスが大量発生してしまう。スバルはロックマンに変身して戦うがあまりの数の多さに大苦戦。装置に目をつけたキャンサーはそれを使えば地球人を滅ぼせると考え、アマケンに乗り込んできた。

テレビの仕事を干されそうになったリブラは、何故こうなってしまったのか思い悩むうち、強気な炎のリブラと弱気な水のリブラ、ふたつの人格に分裂してしまう。炎のリブラはタレント業をやめて地球侵略に集中すべきだと考え、電波変換して暴れ始めた。

リブラは自分の体験を綴った日記を小説の賞に応募、なんと大賞に選ばれてしまう。リブラの作品は大ヒットし、再びリブラブームがおとずれた。しかし弱気な水のリブラは、この地位ももろいものだと悲観する。

手作りの料理でロックマンのハートを射止めると決意したルナはあかねから料理の手ほどきを受けることに。味見役にかり出されたスバルは散々な目に遭う。一方オヒュカスは生活を支えるため、アルバイトに精を出す毎日を送っていた

完成した手作り弁当を手に、ルナはロックマンの出現を心待ちにしていた。その頃、キャンサーが町で騒ぎを起こし人々を混乱に陥れていた。ルナはロックマン様に会える！と喜び勇んで現場へ駆けつける。

地球に近づく電波彗星を観測していたスバル。だがその彗星を目にした途端、ウォーロックの性格が豹変する。礼儀正しく、言葉遣いも丁寧な紳士なウォーロックになってしまったのだ。そして他のＦＭ星人達も彗星の影響を受け、それぞれ性格が変化していた

ウォーロックの性格が変化したまま、恐竜博物館へ見学にやって来たスバルたち。そこにクラウンがやって来て、恐竜の骨格標本と合体し展示室で暴れ始めた。スバルはロックマンに変身して戦おうとするが、紳士なウォーロックは戦いなど野蛮な行為だと非協力的で･･･

宇宙ステーションの残骸が発見されたという連絡を受け、アマケンに駆けつけるスバル。残骸とはブラザーバンドシステム装置で、今もなおＦＭ星に向けて送信を続けているという。ウォーロックは宇宙ステーション襲撃の真相、そして大吾との出会いについて語り始めた。

FM星人たちはアンドロメダ復活を賭け、地球に一斉攻撃をしかけてきた。応戦するロックマンとハープ・ノート。だが戦いの中、キャンサーが持っていたアンドロメダの鍵が壊れてしまい、ＦＭ星人達は愕然とする。